近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所動(dòng)物表觀基因組學(xué)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)運(yùn)用人工智能(AI)來挖掘新型胞嘧啶脫氨酶,開發(fā)了高效、無(wú)序列偏好的胞嘧啶堿基編輯工具。相關(guān)研究成果發(fā)表在《自然生物醫(yī)學(xué)工程(Nature Biomedical Engineering)》上。
挖掘新的功能性蛋白在生物醫(yī)藥和農(nóng)業(yè)應(yīng)用等領(lǐng)域具有重要意義。傳統(tǒng)的挖掘方式忽略了決定蛋白質(zhì)功能的三維結(jié)構(gòu)信息,因此降低了篩選的效率和準(zhǔn)確性。
科研人員利用人工智能的蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)工具和結(jié)構(gòu)聚類方法來挖掘和篩選新的胞嘧啶脫氨酶,并提供了高效率、適用廣泛的候選胞嘧啶脫氨酶用于構(gòu)建胞嘧啶堿基編輯器,有力推進(jìn)胞嘧啶堿基編輯器在生物醫(yī)學(xué)和農(nóng)業(yè)育種等領(lǐng)域的應(yīng)用。
該研究得到了科技創(chuàng)新2030—重大項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金和中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程等資助。
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