據(jù)ETtoday:麻省理工學(xué)院合成生物專家吉姆•柯林斯領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊,發(fā)展出了一個開創(chuàng)性的機(jī)器學(xué)習(xí)方法,讓AI從超過1億個分子庫當(dāng)中,鑒定出可以對殺多種細(xì)菌的強(qiáng)大新型抗生素,其中包括難以治愈的結(jié)核桿菌。
根據(jù)科學(xué)網(wǎng)站pmlive.com報導(dǎo),這個方法可以在沒有使用人類任何假設(shè)的情況下,短短幾天從超過1億個分子的庫中篩選出強(qiáng)大的新型抗生素,這種方法也可以用在分析治療癌癥、神經(jīng)衰退性疾病等其他類型的藥物。
柯林斯說,盡管之前有使用AI輔助其他研究,但是使用AI自行發(fā)現(xiàn)新的抗生素,是首例,研究小組在確定了候選物之后,并在動物實驗中,驗證這些可能是有效果的分子。
柯林斯和他的團(tuán)隊開發(fā)了一種神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)是根據(jù)大腦的結(jié)構(gòu),建構(gòu)的演算模型,可以逐個分析與學(xué)習(xí)分子的特性。
研究人員訓(xùn)練其神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)以發(fā)現(xiàn)抑制的細(xì)菌生長的分子的大腸桿菌,使用的量,抗菌活性被稱為2335分子的集合。其中包括約300種已批準(zhǔn)的抗生素以及800種來自植物,動物和微生物來源的天然產(chǎn)物的文庫。
接著研究小組要求AI預(yù)測哪些分子可以對抗大腸桿菌,并向他們展示看起來與傳統(tǒng)抗生素不同的分子。鑒于世界各地對抗菌素和抗生素耐藥性的問題日益嚴(yán)重,這項研究尤其重要。
麻省理工學(xué)院的AI研究人員,該研究的合著者巴萊茲說,這種算法無需對藥物的工作原理和化學(xué)基團(tuán)進(jìn)行任何標(biāo)記就可以預(yù)測分子功能?!敢虼?,這項模型可以學(xué)習(xí)人類專家未知的新模式」。
麻省理工學(xué)院的這項最新研究既提高了化合物鑒定的準(zhǔn)確性,又降低了篩選工作成本,因此得到了業(yè)內(nèi)很多專家的高度評價。以色列理工學(xué)院的生物學(xué)和電腦科學(xué)教授羅伊•基肖尼表示,這項開創(chuàng)性的研究,代表抗生素發(fā)現(xiàn)甚至更普遍的藥物發(fā)現(xiàn)過程產(chǎn)生了典范轉(zhuǎn)移的變化。
匹茲堡卡內(nèi)基梅隆大學(xué)的計算生物學(xué)家鮑勃•墨菲認(rèn)為,這項研究為使用計算方法發(fā)現(xiàn)和預(yù)測潛在藥物特性增添了一個很好的例子。
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